学校发工资涉及个税缴纳时，可能存在以下法律风险点，需引起重视。
1. 未依法代扣代缴的风险：若学校未按规定为教职工代扣代缴个税，税务机关可能对学校处以罚款。例如，某私立学校未将教职工的课时补贴计入工资薪金，未代扣个税，被税务部门责令补缴税款并处罚款5000元。
2. 个税申报不实的风险：教职工虚假填报专项附加扣除信息（如伪造子女学籍证明），可能被税务机关追缴税款并加收滞纳金，情节严重的还会影响个人信用。例如，某教师虚报赡养老人扣除，被税务系统查出后，补缴税款及滞纳金共计2000余元。
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学校发工资的个税处理存在一些特殊情况，会影响税务处理结果。
1. 非营利性学校的特殊政策：非营利性学校（如公立学校）的教职工工资，若符合《个人所得税法》规定的免税条件（如院士津贴、政府特殊津贴），相关部分可免征个税。例如，公立学校教授获得的政府特殊津贴，不计入应纳税所得额。
2. 外籍教职工的税收优惠：外籍教职工在华工作，符合条件的可享受附加减除费用（目前为每月1300元），即起征点为5000+1300=6300元。例如，某外籍教师月工资8000元，扣除五险一金和附加减除费用后，应纳税所得额可能低于起征点，无需缴税。
3. 临时教职工的劳务报酬计税：学校聘请的临时教职工（如兼职教师），若按劳务报酬发放报酬，需按劳务报酬所得计税（起征点800元，税率20%-40%），与工资薪金的计税方式不同。例如，兼职教师月劳务报酬3000元，需缴纳（3000-800）×20%=440元个税。
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关于学校发工资是否有税的问题，答案是学校发放的工资通常需要缴纳个人所得税。
学校发工资是否有税需结合具体情况判断，主要涉及个人所得税的缴纳。
1. 若教职工月工资收入扣除五险一金、专项附加扣除等后超过5000元起征点：需按综合所得税率表缴纳个人所得税，由学校作为扣缴义务人代扣代缴。
2. 若教职工月工资收入扣除各项后未达5000元起征点：无需缴纳个人所得税，但学校仍需履行全员全额扣缴申报义务。
3. 若教职工属于外籍人员且符合税收优惠条件：可享受附加减除费用等特殊政策，起征点标准更高。
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针对学校发工资需缴纳个人所得税的结论，可依据《中华人民共和国个人所得税法》进行分析。
根据2018年修正的《中华人民共和国个人所得税法》第二条规定，工资、薪金所得属于应当缴纳个人所得税的范围。该法第六条明确，居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额（即每月起征点5000元）。学校作为用人单位，向教职工发放工资属于工资、薪金所得范畴，若教职工收入扣除相关费用后超过起征点，需依法缴纳个人所得税，学校需按规定代扣代缴。因此，学校发工资是否有税，核心是判断教职工的应纳税所得额是否超过法定标准。

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