员工个人所得税是否由公司代交，是许多职场人士关注的焦点。依据相关规定，员工个人所得税通常由公司代扣代缴。
若员工与公司存在雇佣关系，公司在向其支付工资薪金时，作为支付方，依法需履行扣缴义务，代扣代缴个人所得税。
若员工取得劳务报酬所得等其他应税所得且支付方为公司，公司同样可能成为扣缴义务人，需代扣代缴个人所得税。
当员工收入未达个税起征点（当前为月收入5000元）时，公司代扣后应纳税额为零，此时无需实际缴税，但仍需履行申报义务。
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在员工个人所得税代扣代缴工作中，公司若操作不当易引发问题，以下为常见错误行为。
1、未履行代扣义务：部分公司错误认为个税由员工自行申报，支付工资时未代扣。此行为违反《中华人民共和国个人所得税法》关于扣缴义务人的规定，税务机关将予以处罚。
2、代扣税款未及时缴纳：有些公司虽从员工工资中代扣个税，却未在规定申报期内缴至税务机关，或挪作他用、拖延缴纳。这会产生滞纳金，税务机关还会对公司处以罚款。
3、应纳税额计算错误：公司在计算员工个税时，若对税法规定的扣除项目、税率等理解有误，可能导致多扣或少扣税款。多扣损害员工利益，少扣则使公司面临补税和罚款风险。
为避免不必要损失，建议处理员工个税代扣代缴事务时，遇不确定问题可咨询我，我会为您提供详细解答。
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关于员工个人所得税是否由公司代交，【解答内容】中的法律依据有明确规定。
根据《中华人民共和国个人所得税法》（2018年修订）第九条规定：“个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。”在员工取得工资薪金所得时，员工是纳税人，公司作为支付单位即为法定扣缴义务人。这表明公司支付工资时，有义务从员工工资中扣除其个税并代为缴纳给税务机关。因此，员工个人所得税由公司代扣代缴，这是基于法律规定的扣缴义务产生的。
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除员工个人所得税由公司代扣代缴这一常规情况外，还有一些特殊或例外情形会影响处理方式。
1、员工收入未达起征点：若员工每月工资扣除五险一金等费用后低于5000元个税起征点，公司代扣时应纳税额为零。此时公司虽无需实际缴税，但需按规定进行零申报，向税务机关报送员工个税扣缴报告表，以反映其收入和申报状态。
2、员工有多项收入且涉及不同扣缴义务人：若员工除本公司工资薪金外，还从其他单位取得劳务报酬等应税所得，且其他单位也是扣缴义务人。这种情况下，本公司仅需代扣其在本公司的工资薪金个税，其他所得个税由对应扣缴义务人代扣代缴或由员工自行申报汇算清缴。公司需明确仅对本公司支付的所得负责，避免混淆不同来源收入的纳税义务。
3、公司已代扣税款但未及时申报：若公司已从员工工资中代扣个税，却因财务人员疏忽等未在规定申报期内申报。此时公司需尽快补申报并缴纳滞纳金，税务机关会按逾期时间和未缴税款金额加收滞纳金，可能还会批评教育或罚款，影响公司税务信用评级。

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